有机硅类流平剂的改性方法不同，改性材料不同，结构不同，分子量不同，用途也各异。因此在应用时要注意以下几点。
依据问题选择流平剂
硅类流平剂没有什么问题都能解决的“万能型”。如果选择不当会带来负面影响。如要消除表面张力差，最好选择降低表面张力强的、聚醚改性的聚硅氧烷，不要选择烷基改性的聚硅氧烷。要求耐高温烘烤的。就不能选择聚醚改性的，要选择烷基改性或聚酯改性的。要求长期具有滑爽性，不能选择添加性的，要选择反应型的，要求改善界面关系，降低界面张力，最好选用小分子量的聚醚改性的基材润湿剂。
层间附着力问题
这类流平剂虽然经过改性，相容性和附着力问题都得到了改善，但有的还存在问题，迁移性差的流平剂，待涂膜完全干硬后再涂第二层就容易出问题。此外过热烘烤，破坏了流平剂的结构，极易出现附着力的问题。要选择改性剂终端不含活性基的、迁移性好的有机硅流平剂。
另外改善附着力还可选择小分子量的流平剂，因为，短链的硅氧烷，不易在气/液界面形成连续不断的膜，所以增加了面漆和底漆的接触面积，改善了层间附着力。
稳泡性
几乎降低表面张力越强的流平剂稳泡性就越强，特别是聚醚改性的聚硅氧烷，极易在气/液界面处定向排布，在涂料中的空气，被流平剂给“包裹”着形成了气泡。在应用时要特别注意，可以选择不稳泡的或低稳泡的。
热稳定性
在加热固话型涂料中使用时，一定要注意流平剂的耐热范围，烘烤温度要在流平剂的耐热范围内，否则流平剂在过热烘烤时会产生分解，导致涂膜产生缩孔、重涂困难、光泽下降等负面影响。底漆或二道底浆，最好使用不降低表面张力的烷基改性的聚硅氧烷，面漆可采用能够重涂的聚酯改性的聚硅氧烷。
用量及添加方法
用量要视需要而定，总的建议添加量为漆量的0.01%-1.0%，究竟多少为宜，这样视配方组成、溶剂的溶解力、树脂的相容性、助剂之间的相互作用关系等因素而定。添加量不足效果不明显，添加量过大会产生细皱纹，甚至缩孔。所以用量一定要适中。
消除刷痕和辊痕，最好不要使用降低表面张力的流平剂，可用丙烯酸类流平剂或烷基改性的流平剂，尽量保持涂料的表面张力对流平是有帮助的，添加量为0.3-0.5%也可配合溶剂型流平剂一起使用。
消除刷痕和辊痕，最好不要使用降低表面张力的流平剂，可用丙烯酸类流平剂或烷基改性的流平剂，尽量保持涂料的表面张力对流平是有帮助的，添加量为0.3-0.5%也可配合溶剂型流平剂一起使用。
其他流平剂
流平剂还有氟碳类和高沸点溶剂类。氟碳流平剂具有最高表面活性，可将涂料的表面张力降至16-18mN/m,因此具有最强的表面状态控制能力。概括来讲，有机硅流平剂所具备的功能，氟碳类流平剂全部具备，比有机硅类流平剂更好的降低表面张力能力更强，表面状态控制的效果就更好。但也有其负面作用，像层间附着力，稳泡性更难以克服。其价格也特别昂贵，影响了它的应用。